Невелика зміна
Дослідники CDC виявили мутацію EspW, порівнюючи генетичні послідовності 729 ізолятів нового штаму E. coli, названого REPEXH01, з генетичними послідовностями 2,027 інших ізолятів E. coli O157:H7. У всіх, окрім двох, з 729 штамів REPEXH01 була зафіксована однонуклеотидна втрата в EspW (інші два мали неоднозначні послідовності), тоді як у менш ніж 4 відсотках не-REPEXH01 E. coli штамів втрата була присутня. Це відкриття може свідчити про те, що ця незначна зміна є генетичним підписом штаму, а її постійність у важливому білку, що спричиняє захворювання, може надати перевагу цьому штаму.
На сьогодні неясно, яку саме перевагу це може забезпечити. Втрата одного базового елемента ДНК (аденіну) змінює рамку трисекундного білкового коду для решти EspW. Це може призвести до утворення скороченого білка. Також це може викликати зсув в молекулярному механізмі, що перекладає генетичний код, що призведе до утворення білків різної довжини. У будь-якому випадку, така втрата, ймовірно, призведе до менш функціонального білка EspW.
Дослідники CDC припускають, що це може допомогти E. coli, коли вона знаходиться на салаті та інших овочах. Наприклад, EspW може стимулювати імунну реакцію у зараженій рослині, що призводить до закриття пор — продихів на поверхні листя, ускладнюючи проникнення бактерій. Таким чином, зменшення EspW може допомогти E. coli уникати захисту — адаптація у безперервній боротьбі між бактерією та її господарем. Ще один можливий сценарій полягає в тому, що EspW може функціонувати подібно до HopW1, викликаючи більш важкі інфекції в рослинних тканинах, що може зменшити ймовірність того, що заражене листя буде зібране і потрапить до магазинів або на бургери. Отже, зменшення кількості EspW може допомогти E. coli переміститися до своїх людських жертв.
Врешті-решт, буде потрібно додаткове дослідження, щоб зрозуміти, що насправді відбувається. Як підсумували дослідники CDC: “роль мутації в одній базовій парі у колонізації та виживанні цього штаму на листкових овочах може дати цінні відомості.”